Здравствуйте, вот я выставил цену на товар розничную и учетную и теперь удалить эту цену или изменить уже не могу. Если следующая поставка мне придет по учетной цене дороже или решу продавать этот товар дешевле, то как мне поступить? Добавить еще одну розничную и учетную цену и что тогда будет считывать программа? Или я при приходной накладной указываю новую цену поставки, то как быть с ценой внутри товара?

Вы немного не так делаете и понимаете работу программу

Ввод остатков
провели
изменяет УЧЕТНАЯ ЦЕНА товара

Приходная накладная
провели
изменяет УЧЕТНАЯ ЦЕНА товара
и может
изменяет РОЗНИЧНАЯ ЦЕНА товара

Документ Переоценка товара
может изменить любой тип цены

в карточке товара - это для наглядности отображает АКТУАЛЬНУЮ (Текущую) ценУ товара в зависимости от типа ЦЕНЫ

в РЕДКИХ случаях можно ДОБАВЛИЯТЬ цену в РУЧНОМ РЕЖИМЕ (но это не очень хороший вариант)

вы можете и удалить и изменить цену
но логичнее и правильнее - когда ее меняют документы (своими движениями)

Самый простой пример
товар без цены

пришла ПРИХОДНАЯ НАКЛАДНАЯ
указали 100 шт. закупочная цена - 250 руб.
провели
появился остаток и учетная цена

на оснавании документа Приходная накладная
создаем документ ПЕРЕОЦЕНКА товара
указываем РОЗНИЧНАЯ цена - 400 руб.
проводим

смотрим в карточку и видим

УЧЕТНАЯ ЦЕНА 250 руб.
РОЗНИЧНАЯ ЦЕНА - 400 руб

пришло новое поступление
цена товара 280 руб. (подорожало)
проводим документ - анализ ценообразования
вам покажет и порекомендует изменит розничную цену
делаем Переоценка 410 руб.

смотрим в карточку и видим

УЧЕТНАЯ ЦЕНА 280 руб.
РОЗНИЧНАЯ ЦЕНА - 410 руб

Цена - это периодический реквизит (т.е. на каждую дату мы можем получить цену товара)
т.е. сказать в январе товар стоил 210 руб. а в май уже 280 руб.)