Захожу в справочник Номенклатура. Нажимаю правой кнопкой мыши и выбираю "вывести список". Ставлю необходимые галочки, в том числе напротив записи "штрихкод"

Формируется табличный документ, отображается все, что выбрал, кроме штрихкода. Это ошибка?

нет. это не ошибка.
Вывести список - штатная функция платформы - выводит все реквизиты формы списка справочника или документа
Штрихкод не является реквизитом справочника Номенклатуры - это отдельный регистр (в списке для отображения используется отдельная процедура)

Ясно