Делаю инвентаризацию. Когда выбираю Обновить остатки <Учет> Всего, заполняется только те товары, которые оказались с отрицательным или положительным остатком. Но у меня есть позиции остаток по которым 0, но фактически они есть на складе. Как мне сделать, чтобы все товары и с отрицательным остатком, и с нулевым, и с положительным попали в инвентаризацию?

Сканером товар сканируйте, товар добавится.

Все правильно . или в ручную подбор или горячие клавиши ALT+S
Представьте у вас номенклатурных позиций более 10000 шт.
а по факту используется только около 1500 шт.
Программа вам и загружает (подсказывает!) то что есть на остатках.
Хотя по правильному - открыли документ и пошли сканировать , а уже потом смотреть результат.

Спасибо