Конечно можно . И очень просто это сделать.
для наглядности откроем сначала отчет "Остатки товара"
на остатке магазина 222 ед. товара
откроем новый документ Перемещение товара - выберем склад получатель
по меню - ЗАПОЛНИТЬ - все остатки товара (ИМЕННО ВЫБРАННОГО МАГАЗИНА в поле Склад отравитель)
документ заполниться согласно данным остатков на заданный период
количество товара - сходится. Проводим документ.
Заново сформируем отчет "Остатки товара"
товара нет на складе