Здравствуйте! Сложилась следующая ситуация, раньше человек был на ЕНВД и особо не заморачивался с движение товара, остатками, сейчас перешел на доход-расход и бухгалтер сказала, что ей нужно движение товара, остатки. Подскажите, пожалуйста, как мне привести остатки в порядок, заранее извините если что-то не так сформулировал, я занимаюсь web-ом и 1с и тем более бухгалтерия пока для меня темный лес ( просто люди думают раз человек разбирается в серверах и сайтах, то и 1с как семечки), отказать не могу и разбираться со всем этим придется мне. Как мне внести остатки на начало года.

Посмотрите Документ ВВОД ОСТАТКОВ
или что лучше "Инвентаризацию"

Я правильно понимаю, что если создам документ инвентаризация и внесу товары которые есть в наличие или были на начало года, то и остальные товары станут правильно отображаться в остатках, а то там минус 60 даже есть.

Создайте Инвентаризацию - заполнить по остаткам. Ничего больше не меняя. Проведите ее.
Теперь в вашей базе все остатки = 0. Проверьте Отчет "Остатки товара"
Создайте новый документ "Инвентаризация" - просканируйте весь товар. Проведите документ.
Все теперь у вас весь товар посчитан.